Do wszystkich EFIS'ów przygotowane zostało szerokie spectrum programów narzędziowych, ułatwiających konfigurację i korzystanie z przyrządów; Wszystkie te programy, jak również uaktualnienia, można bezpłatnie pobrać ze strony producenta (strona w języku angielskim).
Enigma designer and simulator - program wykorzystywany do projektowania i konfigurowania ekranów oraz symulacji pracy przyrządu na komputerze PC. Doskonały do projektowania i testowania różnych ekranów i ustawień bez konieczności ich instalacji na rzeczywistym przyrządzie. Odtwarza na ekranie wszystkie funkcje prawdziwego przyrządu i pozwala eksperymentować np. z mapami, położeniem GPS, nawigacją, parametrami silnika, tak by sprawdzić, jak działa prawdziwy przyrząd.
Wszystkie ustawienia, zarówno z komputera do przyrządu, jak i z przyrządu do komputera, można przenieść za pośrednictwem jednego pliku skryptowego na karcie SD.
Może służyć również do przechowywania projektów dla różnych statków powietrznych.
Odyssey G2 designer and simulator (również dla Voyagera) - program wykorzystywany do projektowania i konfigurowania ekranów oraz symulacji pracy przyrządu na komputerze PC. Doskonały do projektowania i testowania różnych ekranów i ustawień bez konieczności ich instalacji na rzeczywistym przyrządzie. Odtwarza na ekranie wszystkie funkcje prawdziwego przyrządu i pozwala eksperymentować np. z mapami, położeniem GPS, nawigacją, parametrami silnika, tak by sprawdzić, jak działa prawdziwy przyrząd.
Wszystkie ustawienia, zarówno z komputera do przyrządu, jak i z przyrządu do komputera, można przenieść za pośrednictwem jednego pliku skryptowego na karcie SD.
Może służyć również do przechowywania projektów dla różnych statków powietrznych.
Odyssey G1 designer and simulator (również dla Voyagera) - jak wyżej dla Odysseya / Voyagera Generation 1. Link łączy zarówno do symulatora jak i najnowszej wersji systemu operacyjnego.
EnigmaSound.EXE - program wykorzystywany do rejestracji fraz i alarmów głosowych. Tworzy pojedynczy plik, który można zainstalować w EFIS'ie, zawierający wszystkie zarejestrowne dźwięki. Pozwala także wykorzystać wcześniej zarejestrowane, przy wykorzystaniu innych programów, dźwięki w formacie WAV (należy odpowiednio przemianować i nadpisać istniejące pliki WAV przed stworzeniem pliku dźwiękowego Enigmy).
EnigmaMapMaker.exe - program pozwala na import dowolnej mapy w formacie JPG lub BMP i jej konwersję do formatu stosowanego w EFIS'ie. Mapa jest orientowana względem współrzędnych, skalowana i wyrównywana. W przyszłych wersjach program umożliwi również import map ukształtowania terenu.
MGL Central - nowy program i baza danych do planowania lotu. Posiada obszerną bazę danych oraz możliwość importu baz danych dla wielu źródeł i formatów. Planowanie lotu zawiera zintegrowany interfejs do Google Maps. Program ten zastępuje dotychczasowy program Enigma Flight Planner.
EnigmaBMPtoMIF.exe - program do konwersji grafiki BMP na format EFIS'a MIF. Program ten można wykorzystać do zaprojektowania własnego ekranu powitalnego oraz do przygotowania sylwetki samolotu jako podkładu graficznego do obliczeń ciężaru i środka ciężkości samolotu.
Enigma vector map editor - program do edycji wektorowych map podkładu topograficznego (VMAP.EVD) oraz map przestrzeni powietrznych (Airspace.EVD). Pozwala na tworzenie własnych map wektorowych lub edycję i modyfikacje map istniejących. Program powinien być wykorzystywany z odpowiednimi mapami rastrowymi w tle, tak by w prosty sposób można było nanosić modyfikacje. Odpowiednie mapy dla tła można przygotować z zeskanowanych map lotniczych lub innych za pomocą opisanego powyżej programu EnigmaMapMaker.
Enigma Black Box viewer - program do przeglądania danych rejestrowanych przez tzw. czarną skrzynkę. EFIS może rejestrować na karcie SD wybrane parametry lotu, orientacji, nawigacji i pracy silnika. Niniejszy program umożliwia przeglądanie zarejestrowanych parametrów w rozbiciu na loty, przedstawiać je w formie graficznej i zapisywać je w wielu formatach, w tym w formacie Google Earth, tak by móc obejrzeć trasę lotu w 3D!!! Program instalacyjny zawiera dokumentację w formacie pdf.
MGL Avionics plates compiler - aplikacja pozwalającu na import lotniskowych map podejścia w formatach PDF, JPG i BMP i skompilowanie ich do formatu EFIS'a. Pozwala on łączenie wielu map w jeden plik (np. mapy powiązane z jednym lotniskiem). Mapy mogą być kadrowane i orientowane w stosunku do wspórzędnych geograficznych. Program instalacyjny zawiera dokumentację i samouczek w formacie PDF.
MGL Avionics IOX Scipt file generator/editor - program pozwalający tworzyć i edytować skrypty sterujące działaniem I/O Extender'a. Pozwalają one przypisać określone funkcje poszczególnym portom wejścia i wyjścia w zależności od potrzeb konkretnego zastosowania.